Sans être obligatoire, en l'absence d'activités de prévention, de diagnostic ou de soins, une assurance responsabilité civile est fortement conseillée pour une communauté professionnelle territoriale de santé. Comme le stipule l'article 1240 du Code civil, "tout fait quelconque de l'homme, qui cause à autrui un dommage, oblige celui par la faute duquel il est arrivé à le réparer". La responsabilité d'une CPTS peut ainsi être mise en cause en cas de mauvaise coordination pouvant affecter la prise en charge d'un patient sans médecin traitant, en cas de bris de matériel occasionné par un membre de la CPTS (chute d'un ordinateur portable, vêtement tâché…), en cas de dommages subis à la suite d'une réunion (moquette ou parquet endommagés…), en cas de litige avec un salarié de la CPTS ou un bénévole victime d'un accident. Autant de risques potentiels nécessitant d'être garantis avec une assistance financière et juridique auprès d'un assureur spécialisé, ayant une bonne connaissance du fonctionnement et de l'organisation de ces structures amenées à se développer.